EC-SBM community detection analysis: full pipeline and writeup

Implement community detection on 3 EC-SBM networks (polblogs, topology,
internet_as) using 5 methods (Leiden-Mod, Leiden-CPM at 0.1 and 0.01,
Infomap, graph-tool SBM). Compute AMI/ARI/NMI accuracy, cluster statistics,
and generate figures and LaTeX report.

1 files changed, 1 insertions, 0 deletions

diff --git a/results/stats/polblogs/graphtool_sbm/mixing_params.json b/results/stats/polblogs/graphtool_sbm/mixing_params.json
new file mode 100644
index 0000000..9d2cf4a
--- /dev/null
+++ b/results/stats/polblogs/graphtool_sbm/mixing_params.json
@@ -0,0 +1 @@
+[0.5, 1.0, 0.975609756097561, 0.9790209790209791, 1.0, 0.8823529411764706, 0.8714285714285714, 1.0, 0.9833333333333333, 0.875, 1.0, 1.0, 0.5, 0.33333333333333337, 1.0, 0.975609756097561, 1.0, 0.75, 0.9204545454545454, 0.8181818181818181, 0.5, 0.9863013698630136, 0.9166666666666666, 1.0, 0.9666666666666667, 0.9024390243902439, 1.0, 1.0, 0.7272727272727273, 0.4285714285714286, 1.0, 0.8333333333333334, 1.0, 1.0, 0.8387096774193549, 0.96, 0.7777777777777778, 0.8983050847457628, 0.7777777777777778, 0.9333333333333333, 0.927536231884058, 0.33333333333333337, 0.7777777777777778, 1.0, 0.978021978021978, 0.0, 0.9230769230769231, 0.8181818181818181, 1.0, 0.9090909090909091, 1.0, 0.9333333333333333, 0.8148148148148149, 0.8387096774193549, 0.9230769230769231, 0.875, 1.0, 0.9655172413793104, 1.0, 1.0, 0.8333333333333334, 0.59375, 0.9642857142857143, 0.9393939393939394, 1.0, 1.0, 0.9307692307692308, 0.9464285714285714, 1.0, 1.0, 0.7272727272727273, 0.8, 1.0, 0.7777777777777778, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.90625, 1.0, 0.8611111111111112, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9821428571428571, 0.7, 0.8701298701298701, 0.9148936170212766, 0.9166666666666666, 0.95, 0.9285714285714286, 0.8571428571428572, 0.8888888888888888, 0.8571428571428572, 0.8125, 1.0, 0.9512195121951219, 0.875, 1.0, 0.75, 1.0, 1.0, 0.9387755102040817, 1.0, 0.5, 1.0, 0.5333333333333333, 1.0, 1.0, 1.0, 0.7105263157894737, 0.8888888888888888, 0.75, 1.0, 0.8333333333333334, 1.0, 0.8846153846153846, 0.9523809523809523, 0.5, 0.8823529411764706, 0.33333333333333337, 1.0, 0.9866666666666667, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.7777777777777778, 0.9047619047619048, 0.8695652173913043, 0.9875, 0.9375, 0.5, 1.0, 0.6666666666666667, 0.0, 0.0, 0.8333333333333334, 0.8571428571428572, 0.984375, 1.0, 1.0, 0.9166666666666666, 1.0, 0.78125, 1.0, 0.8913043478260869, 0.8333333333333334, 1.0, 0.9333333333333333, 0.8636363636363636, 0.9285714285714286, 0.8548387096774194, 1.0, 0.5, 0.9714285714285714, 0.5, 1.0, 1.0, 0.8163265306122449, 0.875, 0.9901960784313726, 0.9615384615384616, 0.7272727272727273, 0.8, 0.6666666666666667, 0.8615384615384616, 1.0, 1.0, 1.0, 0.875, 0.9316239316239316, 0.9230769230769231, 0.7142857142857143, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.7037037037037037, 0.9428571428571428, 0.8709677419354839, 0.963855421686747, 0.8333333333333334, 0.8333333333333334, 1.0, 0.8076923076923077, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8656716417910448, 1.0, 1.0, 0.8888888888888888, 0.8, 0.7341772151898734, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.6666666666666667, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9855072463768116, 0.9513888888888888, 0.9701492537313433, 0.0, 1.0, 0.8461538461538461, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9587628865979382, 1.0, 0.9512195121951219, 0.9583333333333334, 1.0, 0.75, 1.0, 1.0, 0.9512195121951219, 0.9411764705882353, 0.8, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8, 0.9166666666666666, 1.0, 0.7, 1.0, 0.9776536312849162, 0.8, 0.5, 0.9285714285714286, 0.9, 0.8571428571428572, 0.75, 1.0, 0.813953488372093, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9852941176470589, 0.9010989010989011, 0.6666666666666667, 0.9421487603305785, 0.6875, 0.5, 1.0, 1.0, 0.9166666666666666, 0.925, 0.9444444444444444, 0.0, 0.8888888888888888, 0.8, 1.0, 1.0, 1.0, 0.7692307692307692, 0.9375, 0.9452054794520548, 0.8979591836734694, 1.0, 0.9454545454545454, 0.0, 0.9444444444444444, 0.8, 1.0, 1.0, 1.0, 0.7848101265822784, 0.925, 0.8333333333333334, 0.8571428571428572, 0.6666666666666667, 1.0, 0.890625, 0.9142857142857143, 0.8695652173913043, 0.8, 1.0, 0.967741935483871, 1.0, 1.0, 0.9230769230769231, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.7647058823529411, 1.0, 1.0, 1.0, 0.75, 1.0, 1.0, 0.8, 1.0, 0.5, 0.75, 0.8450704225352113, 1.0, 1.0, 0.8979591836734694, 0.9411764705882353, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9705882352941176, 0.8947368421052632, 1.0, 1.0, 0.9534883720930233, 1.0, 1.0, 0.8, 1.0, 0.8817204301075269, 0.8484848484848485, 0.9736842105263158, 0.8, 0.9565217391304348, 0.9090909090909091, 0.8846153846153846, 0.9473684210526316, 1.0, 0.972972972972973, 1.0, 1.0, 1.0, 0.896551724137931, 1.0, 1.0, 0.8333333333333334, 1.0, 1.0, 0.95, 1.0, 0.8125, 1.0, 0.9859154929577465, 1.0, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.0, 1.0, 1.0, 0.9166666666666666, 0.9242424242424242, 1.0, 1.0, 0.725, 1.0, 0.7142857142857143, 0.84375, 1.0, 0.9459459459459459, 0.0, 1.0, 0.92, 1.0, 1.0, 0.9375, 1.0, 0.875, 1.0, 0.967741935483871, 0.8518518518518519, 0.75, 0.7058823529411764, 0.75, 0.8333333333333334, 0.96, 1.0, 0.8076923076923077, 1.0, 1.0, 0.9473684210526316, 0.9655172413793104, 0.8148148148148149, 0.9333333333333333, 0.8421052631578947, 1.0, 0.9605263157894737, 1.0, 0.8173076923076923, 0.9189189189189189, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.9456521739130435, 0.9310344827586207, 0.9230769230769231, 0.95, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9333333333333333, 1.0, 1.0, 0.9142857142857143, 1.0, 0.8787878787878788, 1.0, 1.0, 0.9754098360655737, 0.9523809523809523, 0.9120879120879121, 1.0, 0.8793103448275862, 0.8852459016393442, 0.9550561797752809, 1.0, 0.8, 0.9807692307692307, 0.8571428571428572, 1.0, 0.9384615384615385, 0.8518518518518519, 1.0, 0.9545454545454546, 0.9347826086956522, 1.0, 0.9, 0.9230769230769231, 0.9, 1.0, 0.981042654028436, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.85, 0.9829059829059829, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 0.8, 0.59375, 0.6666666666666667, 1.0, 0.8571428571428572, 1.0, 0.8529411764705882, 0.9487179487179487, 0.75, 0.9565217391304348, 1.0, 0.96875, 0.9375, 0.9463087248322147, 0.7818181818181819, 0.9523809523809523, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9113924050632911, 1.0, 1.0, 0.9615384615384616, 0.6428571428571428, 0.8235294117647058, 1.0, 0.9655172413793104, 0.9743589743589743, 1.0, 0.9764705882352941, 1.0, 1.0, 0.75, 1.0, 0.9821428571428571, 1.0, 1.0, 0.5, 0.8333333333333334, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9642857142857143, 0.9622641509433962, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 0.8888888888888888, 1.0, 1.0, 0.8426966292134832, 0.8522727272727273, 0.9565217391304348, 1.0, 0.9523809523809523, 0.8947368421052632, 0.9949748743718593, 1.0, 1.0, 0.5, 0.95, 0.9918032786885246, 0.8333333333333334, 0.9558823529411765, 0.9090909090909091, 0.8, 0.8461538461538461, 0.9875, 1.0, 0.9894736842105263, 1.0, 0.9820627802690582, 0.8529411764705882, 1.0, 0.9259259259259259, 0.8936170212765957, 0.6, 1.0, 0.7727272727272727, 0.9375, 0.9090909090909091, 0.75, 1.0, 0.9767441860465116, 0.9319727891156463, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9411764705882353, 0.7, 0.6666666666666667, 0.5, 0.8571428571428572, 1.0, 1.0, 0.8695652173913043, 0.9736842105263158, 1.0, 0.9714285714285714, 0.9565217391304348, 0.6666666666666667, 0.8823529411764706, 0.8, 0.847457627118644, 0.9130434782608696, 0.8571428571428572, 0.963963963963964, 0.875, 1.0, 0.8, 0.9032258064516129, 1.0, 0.9523809523809523, 1.0, 0.8333333333333334, 1.0, 1.0, 0.9333333333333333, 1.0, 1.0, 0.96, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.8714285714285714, 0.6494845360824743, 1.0, 0.9852941176470589, 0.875, 0.8974358974358975, 0.9487179487179487, 1.0, 0.9117647058823529, 1.0, 1.0, 0.9523809523809523, 0.8571428571428572, 0.7777777777777778, 1.0, 1.0, 0.9, 0.8617021276595744, 0.0, 0.8571428571428572, 0.8571428571428572, 1.0, 0.9333333333333333, 0.9375, 1.0, 0.92, 1.0, 0.9295774647887324, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8513513513513513, 0.9719626168224299, 0.8852459016393442, 0.9876543209876543, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9387755102040817, 0.8409090909090909, 0.8, 1.0, 0.9230769230769231, 0.75, 0.873015873015873, 0.8813559322033898, 0.8636363636363636, 0.9444444444444444, 0.8974358974358975, 0.8850574712643678, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8571428571428572, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9343065693430657, 1.0, 0.6666666666666667, 0.9323308270676691, 0.8823529411764706, 1.0, 1.0, 0.9797979797979798, 0.9727272727272728, 1.0, 1.0, 0.9172932330827068, 1.0, 0.9, 0.88, 0.75, 0.8064516129032258, 0.9, 1.0, 1.0, 0.9090909090909091, 0.85, 0.8, 0.0, 1.0, 1.0, 0.9823529411764705, 0.8888888888888888, 0.9655172413793104, 1.0, 0.7966101694915254, 1.0, 1.0, 0.9423076923076923, 0.5, 0.8571428571428572, 0.7692307692307692, 0.875, 0.9111111111111111, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9411764705882353, 0.9285714285714286, 1.0, 0.9473684210526316, 1.0, 0.9, 1.0, 0.96875, 1.0, 0.6666666666666667, 0.9090909090909091, 1.0, 0.0, 0.96875, 0.9509803921568627, 0.9302325581395349, 0.9, 0.8888888888888888, 0.8823529411764706, 1.0, 1.0, 0.9791666666666666, 1.0, 0.75, 0.8732394366197183, 0.9710144927536232, 0.8717948717948718, 0.9333333333333333, 1.0, 0.9305555555555556, 0.9848484848484849, 0.9523809523809523, 0.881578947368421, 1.0, 0.9333333333333333, 0.7777777777777778, 0.8796296296296297, 0.75, 1.0, 1.0, 0.864406779661017, 0.8333333333333334, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9, 0.9473684210526316, 0.7894736842105263, 0.75, 0.8571428571428572, 0.9523809523809523, 1.0, 1.0, 0.9506172839506173, 0.4, 1.0, 0.8333333333333334, 0.9859154929577465, 0.8148148148148149, 1.0, 1.0, 0.8461538461538461, 0.6363636363636364, 0.625, 0.75, 0.9743589743589743, 0.8620689655172413, 1.0, 0.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8421052631578947, 1.0, 1.0, 0.75, 0.8823529411764706, 0.9411764705882353, 1.0, 0.9661016949152542, 0.9850746268656716, 1.0, 0.8533333333333333, 1.0, 0.8602150537634409, 0.9444444444444444, 0.9811320754716981, 0.76, 0.9, 0.8888888888888888, 0.9803921568627451, 0.75, 0.984, 0.9705882352941176, 0.8125, 0.0, 1.0, 0.75, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8888888888888888, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9926470588235294, 0.8, 0.8461538461538461, 0.9611650485436893, 0.88, 1.0, 0.9, 0.9318181818181819, 0.9142857142857143, 0.5, 1.0, 0.9090909090909091, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9230769230769231, 0.9777777777777777, 1.0, 0.7142857142857143, 0.8333333333333334, 0.9024390243902439, 1.0, 1.0, 0.9487179487179487, 1.0, 0.8888888888888888, 1.0, 1.0, 0.7, 1.0, 0.9090909090909091, 0.9111111111111111, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9743589743589743, 0.9795918367346939, 0.8, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9186991869918699, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8645833333333334, 0.75, 0.0, 0.8125, 0.975, 1.0, 0.9827586206896551, 1.0, 1.0, 0.9655172413793104, 0.8181818181818181, 0.7878787878787878, 0.0, 0.9534883720930233, 1.0, 0.9642857142857143, 0.7924528301886793, 0.9322033898305084, 0.9473684210526316, 0.8055555555555556, 0.96, 0.9375, 1.0, 0.9833887043189369, 1.0, 0.9024390243902439, 0.6666666666666667, 0.8028169014084507, 1.0, 0.9272727272727272, 1.0, 1.0, 0.8571428571428572, 1.0, 0.9047619047619048, 0.6666666666666667, 0.95, 0.9864864864864865, 0.9714285714285714, 1.0, 0.8823529411764706, 0.9692307692307692, 0.75, 0.962962962962963, 0.33333333333333337, 0.925, 0.9047619047619048, 1.0, 0.95, 0.9333333333333333, 0.9555555555555556, 1.0, 0.9285714285714286, 0.9047619047619048, 1.0, 0.9791666666666666, 0.5, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 0.9722222222222222, 1.0, 0.8461538461538461, 0.9795918367346939, 0.9130434782608696, 1.0, 0.0, 0.6, 0.9411764705882353, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9333333333333333, 0.9, 0.9090909090909091, 1.0, 0.8, 0.9464285714285714, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9791666666666666, 0.8333333333333334, 0.8421052631578947, 1.0, 0.9230769230769231, 1.0, 1.0, 0.8333333333333334, 0.33333333333333337, 0.9574468085106383, 0.8421052631578947, 0.984375, 0.8676470588235294, 0.9862385321100917, 0.8, 0.8, 0.6842105263157895, 1.0, 0.9642857142857143, 1.0, 1.0, 0.6578947368421053, 1.0, 0.9, 1.0, 0.9, 0.8, 0.9885057471264368, 0.0, 0.9375, 0.9433962264150944, 0.5, 0.0, 0.9783393501805054, 1.0, 0.8235294117647058, 1.0, 0.8666666666666667, 0.9375, 1.0, 0.8421052631578947, 0.8, 0.9824561403508771, 1.0, 0.5, 1.0, 1.0, 0.7333333333333334, 0.5, 0.9855072463768116, 1.0, 1.0, 0.8, 0.9117647058823529, 1.0, 0.9375, 1.0, 0.9, 1.0, 0.8064516129032258, 1.0, 0.875, 0.9090909090909091, 0.9, 1.0, 0.9230769230769231, 1.0, 0.8571428571428572, 0.9473684210526316, 1.0, 1.0, 0.0, 0.8333333333333334, 0.9423076923076923, 0.98, 1.0, 1.0, 0.8, 1.0, 0.9, 1.0, 0.9285714285714286, 1.0, 1.0, 1.0, 0.0, 0.75, 1.0, 0.9183673469387755, 0.859375, 0.8620689655172413, 0.9140625, 0.75, 0.9166666666666666, 0.9444444444444444, 0.8, 1.0, 1.0, 0.8, 1.0, 0.9166666666666666, 0.9117647058823529, 0.975, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8604651162790697, 0.9090909090909091, 0.8333333333333334, 1.0, 0.8846153846153846, 0.8902439024390244, 0.5, 0.813953488372093, 1.0, 0.8607594936708861, 0.9090909090909091, 0.8571428571428572, 1.0, 0.7857142857142857, 0.9666666666666667, 0.8888888888888888, 1.0, 0.865979381443299, 0.9609375, 1.0, 1.0, 0.9, 1.0, 0.9074074074074074, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9682539682539683, 1.0, 0.6666666666666667, 0.9090909090909091, 1.0, 0.9744525547445255, 1.0, 0.9333333333333333, 0.8, 1.0, 0.8666666666666667, 0.962962962962963, 0.0, 1.0, 1.0, 0.8867924528301887, 0.9743589743589743, 0.5, 1.0, 0.6666666666666667, 0.8571428571428572, 1.0, 0.0, 0.9504950495049505, 0.8333333333333334, 0.8837209302325582, 0.75, 0.0, 1.0, 0.6666666666666667, 0.0, 0.9375, 1.0, 0.9655172413793104, 1.0, 0.875, 0.9444444444444444, 0.90625, 1.0, 0.8888888888888888, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9523809523809523, 0.9444444444444444, 0.9333333333333333, 0.75, 0.9166666666666666, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9838709677419355, 0.6666666666666667, 1.0, 1.0, 0.7272727272727273, 0.9444444444444444, 0.8461538461538461, 0.75, 0.9722222222222222, 0.7692307692307692, 1.0, 0.8928571428571429, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9444444444444444, 1.0, 0.6666666666666667, 1.0, 0.9189189189189189, 1.0, 0.9807692307692307, 1.0, 0.85, 0.875, 1.0, 0.9464285714285714, 0.6666666666666667, 0.8333333333333334, 1.0, 0.9014084507042254, 0.8666666666666667, 1.0, 1.0, 0.8571428571428572, 0.9814814814814815, 0.8294573643410853, 1.0, 0.75, 0.974025974025974, 0.8673469387755102, 1.0, 0.7974683544303798, 0.7857142857142857, 1.0, 1.0, 1.0, 0.9333333333333333, 0.9411764705882353, 0.9882352941176471, 1.0, 1.0, 0.875, 1.0, 1.0, 1.0, 0.5, 1.0, 1.0, 0.9333333333333333, 0.8823529411764706, 0.9491525423728814, 1.0, 0.5, 1.0, 1.0, 0.7857142857142857, 0.8, 0.9090909090909091, 0.7, 0.9761904761904762, 0.7058823529411764, 1.0, 0.9791666666666666, 0.9767441860465116, 1.0, 1.0, 0.9259259259259259, 0.0, 1.0, 0.9285714285714286, 0.5, 0.9912280701754386, 0.6153846153846154, 1.0, 1.0, 0.9285714285714286, 0.9111111111111111, 0.8461538461538461, 1.0, 0.25, 0.9090909090909091, 0.75, 0.8888888888888888, 0.8947368421052632, 0.9230769230769231, 1.0, 1.0, 0.9746835443037974, 0.8571428571428572, 1.0, 0.0, 1.0, 1.0, 1.0, 0.8620689655172413, 0.9090909090909091, 0.75, 0.5, 1.0, 0.8636363636363636, 0.9393939393939394, 0.8055555555555556, 0.9302325581395349, 0.9333333333333333, 0.9166666666666666, 1.0, 1.0, 0.0, 0.935483870967742, 1.0, 0.8333333333333334]
\ No newline at end of file